RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 B8ZZF3 427 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 QSOX1O00391 747 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 GFPT2O94808 682 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 KAT7O95251 611 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 EBLN1P0CF75 366 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS6KB1P23443 525 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 FPR3P25089 353 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 GRIA3P42263 894 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 TUBA3CQ13748 450 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 MRGPREQ86SM8 312 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF366Q8N895 744 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ELP4Q96EB1 424 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 RNFT2Q96EX2 444 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 MLST8Q9BVC4 326 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 VEZTQ9HBM0 779 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 TTC34A8MYJ7 566 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 H3BNC9 293 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PRRG2O14669 202 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 FIBPO43427 364 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ORC4O43929 436 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 HKR1P10072 659 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 LYL1P12980 280 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF20P17024 532 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFS1P28331 727 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 STAT1P42224 750 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 AGTR2P50052 363 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS6KA3P51812 740 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MVDP53602 400 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 DRG2P55039 364 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CTSWP56202 376 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SETQ01105 290 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PTP4A2Q12974 167 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR162Q16538 588 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MEA1Q16626 185 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 GXYLT1Q4G148 440 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC22A25Q6T423 547 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 LCORLQ8N3X6 602 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PDILTQ8N807 584 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNJ9Q92806 393 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 KAZALD1Q96I82 304 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 COQ10AQ96MF6 247 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MMS19Q96T76 1030 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 HCN3Q9P1Z3 774 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00473A8K010 186 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PDE8BO95263 885 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CLEC3BP05452 202 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP4B1P13584 511 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ARSAP15289 507 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PRPH2P23942 346 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 AVPR1BP47901 424 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CDH15P55291 814 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC37A1P57057 533 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 B4GALNT1Q00973 533 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MPP3Q13368 585 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms