RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 MIB1Q86YT6 1006 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 SPATA13Q96N96 652 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CAPS2Q9BXY5 557 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 FNIP2Q9P278 1114 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 E9PAM4 449 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 BANF1O75531 89 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 C4orf22Q6V702 233 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CENPUQ71F23 418 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CCNYQ8ND76 341 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 NCAM2O15394 837 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CSH1P0DML2 217 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CSH2P0DML3 217 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CTSAP10619 480 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ZSCAN26Q16670 478 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 HDAC11Q96DB2 347 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 SLC12A8A0AV02 714 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 RNF103O00237 685 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 SERPINB6P35237 376 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 GARSP41250 739 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ARL4CP56559 192 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 RING1Q06587 406 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 KRT71Q3SY84 523 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 LCHNA4D1U4 455 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 NR1D1P20393 614 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 TUBP50607 506 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 SEMA5AQ13591 1074 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 LRRC31Q6UY01 552 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ZNF567Q8N184 647 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CEP41Q9BYV8 373 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CENPHQ9H3R5 247 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 WASH4PA8MWX3 477 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 KCNK1O00180 336 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 APOEP02649 317 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ABHD2P08910 425 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 MX2P20592 715 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ALDH1A3P47895 512 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 IRAK1P51617 712 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 TWF1Q12792 350 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 MTM1Q13496 603 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 AFMIDQ63HM1 303 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 NLRP14Q86W24 1093 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 SERPINB12Q96P63 405 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 MPP6Q9NZW5 540 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 STK39Q9UEW8 545 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CLUHO75153 1309 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 OPHN1O60890 802 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 APRTP07741 180 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 PTPN3P26045 913 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ZNF534Q76KX8 674 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 IVLP07476 585 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms