RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 CD63P08962 238 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ADD2P35612 726 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 OAZ1P54368 228 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC12A2P55011 1212 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FHL1Q13642 323 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 POSTNQ15063 836 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD1Q15327 319 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SEC23BQ15437 767 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 GPR162Q16538 588 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 RANBP10Q6VN20 620 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM47BQ8NA70 645 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF398Q8TD17 642 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ASB12Q8WXK4 309 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 NPIPB3Q92617 1050 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 WACQ9BTA9 647 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 RASSF1Q9NS23 344 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 RAB21Q9UL25 225 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 DAPP1Q9UN19 280 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 EMSYQ7Z589 1322 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 E7EVH7 732 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 INPPL1O15357 1258 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 DHHO43323 396 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PIP5K1CO60331 668 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TSPAN3O60637 253 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 KRT38O76015 456 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TK1P04183 234 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 AKR1A1P14550 325 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 CCT4P50991 539 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 RCAN1P53805 252 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00205P59089 165 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 EFR3AQ14156 821 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 RUNDC3AQ59EK9 446 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 RRAGAQ7L523 313 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PAF1Q8N7H5 531 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PIGKQ92643 395 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 COQ8BQ96D53 544 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 LUZP4Q9P127 313 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC12A4Q9UP95 1085 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 DPPA5A6NC42 116 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM90A18PA6NE21 464 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM247A6NEH6 219 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM90A16PA6NEW6 464 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SAC3D1A6NKF1 404 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 IKBKBO14920 756 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ANP32CO43423 234 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ENO1P06733 434 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP3A4P08684 503 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms