RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299906.5

FAM199X-201, Transcript of family with sequence similarity 199, X-linked, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAM199X, Length 2,237 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM199X-201ENST00000299906 REV3LO60673 3130 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 SMAPO00193 183 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 TGM5O43548 720 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 TMEM63AO94886 807 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 METTL18O95568 372 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 MX2P20592 715 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 HOXC13P31276 330 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 BMPR1AP36894 532 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 EPHB3P54753 998 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CREMQ03060 361 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 AUHQ13825 339 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 HIF1AQ16665 826 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 MS4A13Q5J8X5 152 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 HECTD3Q5T447 861 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 FAXCQ5TGI0 409 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 C4orf22Q6V702 233 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CEP128Q6ZU80 1094 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 TADA2BQ86TJ2 420 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ZNF276Q8N554 614 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 TBC1D31Q96DN5 1066 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 C9orf72Q96LT7 481 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 NACA2Q9H009 215 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 KLC2Q9H0B6 622 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ETNK1Q9HBU6 452 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 MPP6Q9NZW5 540 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 SEPT10Q9P0V9 454 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 VPS18Q9P253 973 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 VANGL2Q9ULK5 521 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 GOLGA8KD6RF30 607 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 KCNK1O00180 336 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CHADO15335 359 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 IGLV3-27P01718 113 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 GARSP41250 739 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 RING1Q06587 406 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 GALNT2Q10471 571 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 PLD1Q13393 1074 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 KCNJ11Q14654 390 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CENPUQ71F23 418 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CEP41Q9BYV8 373 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CENPHQ9H3R5 247 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 NINJ2Q9NZG7 142 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 MAFFQ9ULX9 164 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 INSL5Q9Y5Q6 135 aa10.13□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 MYO7AQ13402 2215 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 A0A0A0MRY4 1105 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 GOLGA6L10A6NI86 522 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 RNF103O00237 685 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ALOX15BO15296 676 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 COCHO43405 550 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CSPG5O95196 566 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 APRTP07741 180 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 MYZAPP0CAP1 466 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 CTNNB1P35222 781 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 KCNQ1P51787 676 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 GYS2P54840 703 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ARL4CP56559 192 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ERVFC1P60507 584 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 WASHC5Q12768 1159 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 MTM1Q13496 603 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 TTMPQ5BVD1 217 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 KCTD16Q68DU8 428 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 LRRC31Q6UY01 552 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ZBED8Q8IZ13 594 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 ZNF683Q8IZ20 524 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 LZTR1Q8N653 840 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 PSMG2Q969U7 264 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 HDAC11Q96DB2 347 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 SPATA13Q96N96 652 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 TCF25Q9BQ70 676 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 TMBIM4Q9HC24 238 aa10.12□□□□□ -0.79
FAM199X-201ENST00000299906 NDFIP2Q9NV92 336 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms