RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 TEAD4Q15561 434 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 HLA-BQ31612 363 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 DCAF6Q58WW2 860 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 TAC4Q86UU9 113 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 KNL1Q8NG31 2342 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 E5RJQ4 531 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 USP8P40818 1118 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 BNC1Q01954 994 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ARID5BQ14865 1188 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 GBP6Q6ZN66 633 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 USP30Q70CQ3 517 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 LGI2Q8N0V4 545 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 BIRC7Q96CA5 298 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 MYO19Q96H55 970 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 42.9
NEDD8-201ENST00000250495 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 KLK13Q9UKR3 277 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1B0GVT2 93 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SLC9A1P19634 815 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 TACR2P21452 398 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 FSCBQ5H9T9 825 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CHSY1Q86X52 802 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 GANCQ8TET4 914 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 MRGPRX3Q96LB0 322 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 MTG2Q9H4K7 406 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 IL21RQ9HBE5 538 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ACP6Q9NPH0 428 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CEP83Q9Y592 693 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SIN3BO75182 1162 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 FSBPO95073 299 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 IGLV3-25P01717 112 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 GLI1P08151 1106 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SLC2A3P11169 496 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CD27P26842 260 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 PDCLQ13371 301 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 GJB7Q6PEY0 223 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 GLRX5Q86SX6 157 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 F5H5T6 163 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CBFA2T3O75081 653 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 GRIA4P48058 902 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 UBE2HP62256 183 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CDK17Q00537 523 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ECT2LQ008S8 904 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SLC12A1Q13621 1099 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CAMK4Q16566 473 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 KIF19Q2TAC6 998 aa21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms