RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	PFKP	Q01813	784 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	ANO4	Q32M45	955 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARMC3	Q5W041	872 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882		R4GN57	208 aa		13.02	□□□□□ -0.32
RABGEF1-209	ENST00000607882	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	GJA4	P35212	333 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	KDSR	Q06136	332 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	MTAP	Q13126	283 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	NNT	Q13423	1086 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	ASIC2	Q16515	512 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	EML3	Q32P44	896 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	KLKB1	P03952	638 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SHC3	Q92529	594 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	CPXM1	Q96SM3	734 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	TSPAN3	O60637	253 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	GJB6	O95452	261 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	EGF	P01133	1207 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPD2	P43304	727 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	FZD5	Q13467	585 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	CNGA2	Q16280	664 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNK3	O14649	394 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	PMM2	O15305	246 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAD51C	O43502	376 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYP17A1	P05093	508 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	PAEP	P09466	180 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	GALK1	P51570	392 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	STARD6	P59095	220 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	PTK2	Q05397	1052 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	LPAL2	Q16609	132 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	MME	P08473	750 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	WAS	P42768	502 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	LIG3	P49916	1009 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	USP4	Q13107	963 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		12.99	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDUFAB1	O14561	156 aa		12.99	□□□□□ -0.33
RABGEF1-209	ENST00000607882	NCAM1	P13591	858 aa		12.99	□□□□□ -0.33

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