RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	TBL1X	O60907	577 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF202	O95125	648 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	IGLV3-27	P01718	113 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	DNTT	P04053	509 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	VDR	P11473	427 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	CD27	P26842	260 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	PRCP	P42785	496 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	RGS7	P49802	495 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	IL9R	Q01113	521 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	LRMP	Q12912	555 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	PNOC	Q13519	176 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	TEAD4	Q15561	434 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	LMLN	Q96KR4	655 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	FAM149A	A5PLN7	773 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	ACSL4	O60488	711 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	CALCA	P01258	141 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	IGHV4-34	P06331	123 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	CTSK	P43235	329 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	CCT8	P50990	548 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	ZBTB16	Q05516	673 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	SCML4	Q8N228	414 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	IGSF8	Q969P0	613 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	SLC35C1	Q96A29	364 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	SGK2	Q9HBY8	427 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	STIM2	Q9P246	746 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	ATRX	P46100	2492 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	LAMA5	O15230	3695 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	TNFSF14	O43557	240 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SIN3B	O75182	1162 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	LTF	P02788	710 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	GRK6	P43250	576 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CYP4F3	Q08477	520 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM270	Q6UE05	265 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	KAT5	Q92993	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SLC6A18	Q96N87	628 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	EBF2	Q9HAK2	575 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	DKK4	Q9UBT3	224 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909		A0A1W2PP55	124 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909		M0QYV0	167 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	MID1	O15344	667 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	IRAK2	O43187	625 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	WNT1	P04628	370 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FYN	P06241	537 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PAEP	P09466	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CSK	P41240	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SLC11A2	P49281	568 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	GALC	P54803	685 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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