RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ISCUQ9H1K1 167 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 FRYLO94915 3013 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 DRGXA6NNA5 263 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 NPC1O15118 1278 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TBL1XO60907 577 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PAGE1O75459 146 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 APOEP02649 317 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 CALB1P05937 261 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TNFAIP3P21580 790 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 NTSR1P30989 418 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 MRE11P49959 708 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 DGKEP52429 567 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PLK1P53350 603 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ASIC2Q16515 512 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RAB6CQ53S08 254 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 FSCBQ5H9T9 825 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 FBXL22Q6P050 247 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 WDR59Q6PJI9 974 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 C14orf80Q86SX3 495 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 DRC7Q8IY82 874 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 EMC1Q8N766 993 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ATRIPQ8WXE1 791 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ALG14Q96F25 216 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RAB6CQ9H0N0 254 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 NENFQ9UMX5 172 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 HS3ST4Q9Y661 456 aa16.05■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 FAM170AA1A519 330 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 GJB6O95452 261 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 APBB3O95704 486 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 KRT3P12035 628 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SKILP12757 684 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PTPRNQ16849 979 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 EOGTQ5NDL2 527 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SARM1Q6SZW1 724 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 STRADAQ7RTN6 431 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 LGI2Q8N0V4 545 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 IGSF8Q969P0 613 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 MYO19Q96H55 970 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 HAPLN3Q96S86 360 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TMEM245Q9H330 911 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 WDCPQ9H6R7 721 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 WASH3PC4AMC7 463 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 LMNAP02545 664 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PDGFRAP16234 1089 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ABCB4P21439 1286 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RRM1P23921 792 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 CD70P32970 193 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SULT1E1P49888 294 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 HDAC4P56524 1084 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 DEUP1Q05D60 604 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 KLHL30Q0D2K2 578 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 NME3Q13232 169 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 VSTM4Q8IW00 320 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 CFAP52Q8N1V2 620 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 HHIPQ96QV1 700 aa16.03■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ABCB8Q9NUT2 735 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms