RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585291.5

NFE2L1-222, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L1, Length 4,390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-222	ENST00000585291	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	PARP6	Q2NL67	630 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	LINC00523	Q86TU6	105 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	AP3B1	O00203	1094 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CHUK	O15111	745 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TM9SF1	O15321	606 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CFLAR	O15519	480 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	GPR32	O75388	356 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM155B	O75949	473 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	GLRB	P48167	497 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	KAT2B	Q92831	832 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MTBP	Q96DY7	904 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	NEMP1	O14524	444 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CABYR	O75952	493 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	UGP2	Q16851	508 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	NFKB1	P19838	968 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	YWHAQ	P27348	245 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCL23	P55773	120 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MPP3	Q13368	585 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	EVPL	Q92817	2033 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	DNAJB2	P25686	324 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	GEM	P55040	296 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TOMM70	O94826	608 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MYL2	P10916	166 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	KCNE1	P15382	129 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	TAC1	P20366	129 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	L1CAM	P32004	1257 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	ABLIM1	O14639	778 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	GLRA3	O75311	464 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	PGAM1	P18669	254 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	DAOA	P59103	153 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NFE2L1-222	ENST00000585291	MUC3B	Q9H195	1237 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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