RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 NAT9Q9BTE0 207 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TOR3AQ9H497 397 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQ72 361 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 K7ERI5 159 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TBC1D4O60343 1298 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 UNC5CO95185 931 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SHBGP04278 402 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SETD9Q8NE22 299 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 EBF2Q9HAK2 575 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SIP14410 1827 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MAGEB2O15479 319 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GABBR2O75899 941 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ABL1P00519 1130 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 LYNP07948 512 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NUDT17P0C025 328 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GCLMP48507 274 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DYNLT1P63172 113 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 FKBP1BP68106 108 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF844Q08AG5 666 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 WDR49Q8IV35 697 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ECSITQ9BQ95 431 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SPON1Q9HCB6 807 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 RLFQ13129 1914 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 BTBD19C9JJ37 291 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJB5O75953 348 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 STBD1O95210 358 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CALB1P05937 261 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 HADHAP40939 763 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 RAPH1Q70E73 1250 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SEC14L1Q92503 715 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 DCLK3Q9C098 648 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 RAG1P15918 1043 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ALOX12P18054 663 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CDK7P50613 346 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 STAT5BP51692 787 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PTENP60484 403 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SLC12A1Q13621 1099 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 UGCGQ16739 394 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 UGP2Q16851 508 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 KRT35Q92764 455 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 C9orf72Q96LT7 481 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 C5orf60A6NFR6 353 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRD-214ENST00000540109 GNB5O14775 395 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms