RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 MYLIPQ8WY64 445 aa22.76■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 HAUS1Q96CS2 278 aa22.76■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 FAF2Q96CS3 445 aa22.76■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.76■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 S1PR5Q9H228 398 aa22.76■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 CCL26Q9Y258 94 aa22.76■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 F5H5T6 163 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 TACR2P21452 398 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 HTR7P34969 479 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 C2orf54Q08AI8 447 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 NADSYN1Q6IA69 706 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 BBS12Q6ZW61 710 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 FGF13Q92913 245 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.75■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ERCC2P18074 760 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 LTBRP36941 435 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ADGRF1Q5T601 910 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 LGI2Q8N0V4 545 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 PQLC3Q8N755 202 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 NR2E1Q9Y466 385 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 DPYSQ14117 519 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 FBXL22Q6P050 247 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 HTR3DQ70Z44 454 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 TTC13Q8NBP0 860 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 P3H4Q92791 437 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC188H7C350 402 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 PRAMEF12O95522 483 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 LATS1O95835 1130 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 MTHFRP42898 656 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 MANEALQ5VSG8 457 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 GPR153Q6NV75 609 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 PLD5Q8N7P1 536 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 GDE1Q9NZC3 331 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 MPP6Q9NZW5 540 aa22.73■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 APOC2P02655 101 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 TGM2P21980 687 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 SLC6A4P31645 630 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 POTEHQ6S545 545 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 NPNTQ6UXI9 565 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 Q6ZNB5 142 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 DEFB123Q8N688 67 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 PPM1EQ8WY54 764 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 REV3LO60673 3130 aa22.72■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 E2F8A0AVK6 867 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 GREM1O60565 184 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 TSPAN3O60637 253 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 FOSL2P15408 326 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 SNX1Q13596 522 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 COL19A1Q14993 1142 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 PRELID2Q8N945 189 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 IGSF8Q969P0 613 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 CD207Q9UJ71 328 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 CDH7Q9ULB5 785 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 SZT2Q5T011 3432 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 DCLK1O15075 740 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms