RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 CBX8Q9HC52 389 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 MYO6Q9UM54 1294 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 RAD54BQ9Y620 910 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKRD62A6NC57 917 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 DCLK1O15075 740 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 EPHX1P07099 455 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SGSHP51688 502 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 OXCT1P55809 520 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 FMO1Q01740 532 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF234Q14588 700 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC25A52Q3SY17 297 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 PLK5Q496M5 336 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 BRMS1LQ5PSV4 323 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 MBLAC2Q68D91 279 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 LPCAT2Q7L5N7 544 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ERLEC1Q96DZ1 483 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 AGPAT1Q99943 283 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 FUCA2Q9BTY2 467 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ADAM22Q9P0K1 906 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa27.75■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 WASH3PC4AMC7 463 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CALB1P05937 261 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 TNFAIP3P21580 790 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 LMNB2Q03252 620 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 IQCB1Q15051 598 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 C2CD6Q53TS8 623 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRC31Q6UY01 552 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC36A4Q6YBV0 504 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC30A5Q8TAD4 765 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 P2RY11Q96G91 374 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 C11orf70Q9BRQ4 267 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SIK2Q9H0K1 926 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM186AA6NE01 2351 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 VPS13AQ96RL7 3174 aa27.74■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A1W2PQC6 194 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A1W2PQF6 199 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ASLP04424 464 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 TPM3P06753 285 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 DLDP09622 509 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ACADMP11310 421 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 GABRG2P18507 467 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SDHBP21912 280 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 MMP8P22894 467 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 IL12RB1P42701 662 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 LRSAM1Q6UWE0 723 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 LUZP1Q86V48 1076 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 RLN3Q8WXF3 142 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SORCS1Q8WY21 1168 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 NPY6RQ99463 290 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SUN2Q9UH99 717 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 HCN2Q9UL51 889 aa27.73■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CHRNB2P17787 502 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SDC4P31431 198 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 NNMTP40261 264 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGAP8P85298 464 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CREB5Q02930 508 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ASIC2Q16515 512 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SELENOOQ9BVL4 669 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 TKTL2Q9H0I9 626 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SEMA4GQ9NTN9 838 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa27.72■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A1B0GTH6 734 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 NDUFS2O75306 463 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 EPN2O95208 641 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CD70P32970 193 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 P2RY2P41231 377 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 UBASH3AP57075 661 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC12A1Q13621 1099 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 AUHQ13825 339 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CSRP2Q16527 193 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ARL13BQ3SXY8 428 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 SFMBT2Q5VUG0 894 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA1211LQ6NV74 962 aa27.71■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ARCQ7LC44 396 aa27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms