RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468599.1

CNOT10-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT10, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-211ENST00000468599 RCCD1A6NED2 376 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 PROB1E7EW31 1015 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 TULP3O75386 442 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 EGFP01133 1207 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 H2AFZP0C0S5 128 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 TMEM253P0C7T8 217 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 AOC1P19801 751 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 TACR2P21452 398 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 PSMA2P25787 234 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 NBL1P41271 181 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 SLC11A2P49281 568 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 GAD2Q05329 585 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 H2AFVQ71UI9 128 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CFAP52Q8N1V2 620 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 ATRIPQ8WXE1 791 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CD101Q93033 1021 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 IGSF8Q969P0 613 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 MSANTD3Q96H12 275 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CNPY3Q9BT09 278 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 PRR23AA6NEV1 266 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 FAM72CH0Y354 149 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 MAP3K13O43283 966 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 LRCH4O75427 683 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 NDUFA10O95299 355 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 DCNP07585 359 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CHRNB1P11230 501 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CHKAP35790 457 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 GALK1P51570 392 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CCINQ13939 588 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 GAS6Q14393 721 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 MANEALQ5VSG8 457 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 FBXL22Q6P050 247 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 Q6ZS52 159 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 FAM72BQ86X60 149 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 LGI2Q8N0V4 545 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 DTWD2Q8NBA8 298 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 RNF34Q969K3 372 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 NTAN1Q96AB6 310 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 DESI2Q9BSY9 194 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 WDCPQ9H6R7 721 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 FBXO10Q9UK96 956 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 HCN2Q9UL51 889 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.68□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 FAM170BA6NMN3 283 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 MAN2B1O00754 1011 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 TBL1XO60907 577 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 F9P00740 461 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CISD3P0C7P0 127 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 SLC2A3P11169 496 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 IL1R2P27930 398 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CCZ1BP86790 482 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 SCAPQ12770 1279 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 NR1H3Q13133 447 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 ANGPT1Q15389 498 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 CA9Q16790 459 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 GEN1Q17RS7 908 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 MPPE1Q53F39 396 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 TERB1Q8NA31 727 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 DDI1Q8WTU0 396 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 RFFLQ8WZ73 363 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 SHDQ96IW2 340 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 LMLNQ96KR4 655 aa11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CNOT10-211ENST00000468599 SIK2Q9H0K1 926 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms