RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 NOD1Q9Y239 953 aa26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 USH1CQ9Y6N9 552 aa26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 COPEO14579 308 aa26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 F9P00740 461 aa26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYP11A1P05108 521 aa26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 NCALDP61601 193 aa26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYB5D1Q6P9G0 228 aa26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTC17Q96AE7 1141 aa26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 WDCPQ9H6R7 721 aa26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 SDR42E2A6NKP2 422 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNK1O00180 336 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT38O76015 456 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 DHRS4L1P0CG22 281 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TUSC3Q13454 348 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PID1Q7Z2X4 250 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PTPRN2Q92932 1015 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM209Q96SK2 561 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TKTL2Q9H0I9 626 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 HCAR3P49019 387 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC15Q0P6D6 951 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 BSPRYQ5W0U4 402 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 MOCS1Q9NZB8 636 aa25.99■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 M0QZQ0 153 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 RFPL1O75677 317 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 ELNP15502 786 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 YY1P25490 414 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 MGAT1P26572 445 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PM20D1Q6GTS8 502 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR10T2Q8NGX3 314 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 IRGQQ8WZA9 623 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 IGSF9Q9P2J2 1179 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 DSEQ9UL01 958 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 SNX10Q9Y5X0 201 aa25.98■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 ITGB1P05556 798 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CXCR3P49682 368 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CAP1Q01518 475 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 FYB2Q5VWT5 728 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 UNC5BQ8IZJ1 945 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 NPWQ8N729 165 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 C10orf82Q8WW14 230 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 NPHS2Q9NP85 383 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 NEFHP12036 1026 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 SETDB1Q15047 1291 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 MROH9Q5TGP6 573 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 STEAP4Q687X5 459 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHSY1Q86X52 802 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 APBB2Q92870 758 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 MTBPQ96DY7 904 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PKMYT1Q99640 499 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR12D3Q9UGF7 316 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAD54BQ9Y620 910 aa25.97■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CFAP73A6NFT4 308 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 F8W810 466 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PTPN3P26045 913 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 ITGA7Q13683 1181 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYS1Q717R9 158 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TAC4Q86UU9 113 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARNTL2Q8WYA1 636 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYLK2Q9H1R3 596 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM51Q9NW97 253 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHKBQ9Y259 395 aa25.96■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 HMX2A2RU54 273 aa25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 ALDH3A1P30838 453 aa25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF34Q969K3 372 aa25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 UROC1Q96N76 676 aa25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC37BQ96QE4 947 aa25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 EPAS1Q99814 870 aa25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC13A1Q9BZW2 595 aa25.95■■□□□ 1.75
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 NCAM2O15394 837 aa25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ALDH1A2O94788 518 aa25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SKIP12755 728 aa25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SERPINB9P50453 376 aa25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
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