RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F9P00740 461 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BDNFP23560 247 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TUSC3Q13454 348 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARP6Q2NL67 630 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL13BQ3SXY8 428 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STEAP4Q687X5 459 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHSY1Q86X52 802 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HASPINQ8TF76 798 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APBB2Q92870 758 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MANSC1Q9H8J5 431 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MOCS1Q9NZB8 636 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa19.26■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR27A2RRH5 827 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 M0QZQ0 153 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPEO14579 308 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HGSO14964 777 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT38O76015 456 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BMPR2Q13873 1038 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PM20D1Q6GTS8 502 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYS1Q717R9 158 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C10orf82Q8WW14 230 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRGQQ8WZA9 623 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPRN2Q92932 1015 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGBD4Q96DM1 585 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKMYT1Q99640 499 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMLHEQ9NVH6 421 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGSF9Q9P2J2 1179 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAD54BQ9Y620 910 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPRDP23468 1912 aa19.25■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP73A6NFT4 308 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDR42E2A6NKP2 422 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNK1O00180 336 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFPL1O75677 317 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CST5P28325 142 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CXCR3P49682 368 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRADDP78560 199 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10T2Q8NGX3 314 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTBPQ96DY7 904 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DSEQ9UL01 958 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLRC5Q86WI3 1866 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDH1A2O94788 518 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNFP41002 786 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BSPRYQ5W0U4 402 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASC4Q6P4E1 433 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPWQ8N729 165 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RSPH1Q8WYR4 309 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDCPQ9H6R7 721 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PATJQ8NI35 1801 aa19.24■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMX2A2RU54 273 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCAM2O15394 837 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MGAT1P26572 445 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAP1Q01518 475 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FYB2Q5VWT5 728 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PID1Q7Z2X4 250 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRTM3Q86VH5 581 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARNTL2Q8WYA1 636 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC17Q96AE7 1141 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM209Q96SK2 561 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TKTL2Q9H0I9 626 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOD1Q9Y239 953 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHKBQ9Y259 395 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THSD7BQ9C0I4 1608 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGB1P05556 798 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPN3P26045 913 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDH3A1P30838 453 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINB4P48594 390 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINB9P50453 376 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SETDB1Q15047 1291 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OVOS1Q6IE37 1185 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAC4Q86UU9 113 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UNC5BQ8IZJ1 945 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCML4Q8N228 414 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UROC1Q96N76 676 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPAS1Q99814 870 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYLK2Q9H1R3 596 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPHS2Q9NP85 383 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MKS1Q9NXB0 559 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR12D3Q9UGF7 316 aa19.23■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCTN3O75935 186 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELNP15502 786 aa19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms