RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 ZMYND15Q9H091 742 aa21.61■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 KLC2Q9H0B6 622 aa21.61■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.61■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 EFEMP1Q12805 493 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 KYNUQ16719 465 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 URODP06132 367 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 PPM1AP35813 382 aa21.59■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 TMEM51Q9NW97 253 aa21.59■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 METTL18O95568 372 aa21.59■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 KCTD16Q68DU8 428 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 C14orf80Q86SX3 495 aa21.59■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 C9orf72Q96LT7 481 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 SMAPO00193 183 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 ALOX15BO15296 676 aa21.58■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 GPR65Q8IYL9 337 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 C1orf74Q96LT6 269 aa21.58■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
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GPC1-202ENST00000420138 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC1-202ENST00000420138 GBF1Q92538 1859 aa21.58■■□□□ 1.04
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GPC1-202ENST00000420138 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 HTR7P34969 479 aa21.57■■□□□ 1.04
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GPC1-202ENST00000420138 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.57■■□□□ 1.04
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GPC1-202ENST00000420138 A0A0A0MRY4 1105 aa21.57■■□□□ 1.04
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GPC1-202ENST00000420138 TEX28O15482 410 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 SLC2A3P11169 496 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 AP1B1Q10567 949 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CBLBQ13191 982 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 HIF1AQ16665 826 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 EMC10Q5UCC4 262 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-202ENST00000420138 CEP128Q6ZU80 1094 aa21.57■■□□□ 1.04
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