RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384664.1

RNU6-1060P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1060, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1060P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MCM2P49736 904 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SLC37A1P57057 533 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TAS2R50P59544 299 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 YPEL5P62699 121 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GHRHRQ02643 423 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DCTN1Q14203 1278 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ANKRD40Q6AI12 368 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 UEVLDQ8IX04 471 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HMGB4Q8WW32 186 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ZFPM2Q8WW38 1151 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CPT1BQ92523 772 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 COQ8BQ96D53 544 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GPR78Q96P69 363 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SH2D3AQ9BRG2 576 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SLC12A4Q9UP95 1085 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LZTS1Q9Y250 596 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CNTN5O94779 1100 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CD63P08962 238 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CTSAP10619 480 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TFEBP19484 476 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TGM2P21980 687 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SLC12A2P55011 1212 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GALNTL6Q49A17 601 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MTX3Q5HYI7 312 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ZNF626Q68DY1 528 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MYCT1Q8N699 235 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPATA5Q8NB90 893 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 OR6Y1Q8NGX8 325 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 THAP4Q8WY91 577 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PIGKQ92643 395 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ATP2A3Q93084 1043 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRIM2Q9C040 744 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RAB21Q9UL25 225 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TBC1D3EA0A087X179 549 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TBC1D3BA6NDS4 549 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TBC1D3LB9A6J9 549 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 H0Y3Z8 333 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TLR2O60603 784 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CYP21A2P08686 494 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TBC1D3HP0C7X1 549 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 AKR1A1P14550 325 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SERPINA4P29622 427 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ABCG1P45844 678 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PRKG1Q13976 671 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 EFR3AQ14156 821 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 POSTNQ15063 836 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms