RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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SPHK1-201ENST00000323374 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CEP41Q9BYV8 373 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 USH1CQ9Y6N9 552 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 COPEO14579 308 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 DHRS4L1P0CG22 281 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CSH1P0DML2 217 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CSH2P0DML3 217 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ETV4P43268 484 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CXCR3P49682 368 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 BNIP1Q12981 228 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ITGA7Q13683 1181 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 STEAP4Q687X5 459 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CASC4Q6P4E1 433 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 OTOAQ7RTW8 1153 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CCNJLQ8IV13 435 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 SCML4Q8N228 414 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 PKMYT1Q99640 499 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 EPAS1Q99814 870 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 MANSC1Q9H8J5 431 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CENPFP49454 3210 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 WDR27A2RRH5 827 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 PID1Q7Z2X4 250 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CHSY1Q86X52 802 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 AMHP03971 560 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ELNP15502 786 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 SERPINB9P50453 376 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 FYB2Q5VWT5 728 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 KLC4Q9NSK0 619 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 SQORQ9Y6N5 450 aa22.36■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CFAP73A6NFT4 308 aa22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 UGT1A9O60656 530 aa22.35■■□□□ 1.17
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SPHK1-201ENST00000323374 TSPY1Q01534 308 aa22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 SUSD3Q96L08 255 aa22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ECT2Q9H8V3 914 aa22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 OR12D3Q9UGF7 316 aa22.35■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 KCNK1O00180 336 aa22.34■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CABYRO75952 493 aa22.34■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ALDH1A2O94788 518 aa22.34■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 MX2P20592 715 aa22.34■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 PTPN3P26045 913 aa22.34■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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SPHK1-201ENST00000323374 TAC4Q86UU9 113 aa22.34■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.34■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TTC17Q96AE7 1141 aa22.34■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM209Q96SK2 561 aa22.34■■□□□ 1.17
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SPHK1-201ENST00000323374 RFPL1O75677 317 aa22.34■■□□□ 1.17
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SPHK1-201ENST00000323374 YY1P25490 414 aa22.34■■□□□ 1.17
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SPHK1-201ENST00000323374 MTSS1O43312 755 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ITGB1P05556 798 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TYMPP19971 482 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CNTFP26441 200 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CCNFP41002 786 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 BEND5Q7L4P6 421 aa22.33■■□□□ 1.17
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