RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 MAGEA6P43360 314 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 SERPINB9P50453 376 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 CDH8P55286 799 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 GALNT4Q8N4A0 578 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 PPP4R1Q8TF05 950 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 CEPT1Q9Y6K0 416 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 CNTNAP1P78357 1384 aa21.08■□□□□ 0.97
PMS1-222ENST00000639501 AIM2O14862 343 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 NUDT2P50583 147 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 HDAC4P56524 1084 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 ZNF699Q32M78 642 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 WDR49Q8IV35 697 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 AGR3Q8TD06 166 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 HSPBAP1Q96EW2 488 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 COG4Q9H9E3 785 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 PLK2Q9NYY3 685 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MOCS1Q9NZB8 636 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 BTBD7Q9P203 1132 aa21.08■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 GLRA3O75311 464 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 PSAPP07602 524 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 SERPINB5P36952 375 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 RNF148Q8N7C7 305 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 ZNF781Q8N8C0 355 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 PGBD4Q96DM1 585 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 OR52B2Q96RD2 323 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TWNKQ96RR1 684 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 Q9H521 79 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 STK39Q9UEW8 545 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TRMUO75648 421 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TRPA1O75762 1119 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 GRAP2O75791 330 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 ACTR2P61160 394 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 SULT2A1Q06520 285 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 DBN1Q16643 649 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 RIN3Q8TB24 985 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 LRRC39Q96DD0 335 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 LRGUKQ96M69 825 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 RTKNQ9BST9 563 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 COPG2Q9UBF2 871 aa21.07■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 WDR27A2RRH5 827 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 F7P08709 466 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MYL4P12829 197 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TFDP2Q14188 446 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 USP41Q3LFD5 358 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 PKP2Q99959 881 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 PORCNQ9H237 461 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 LHX5Q9H2C1 402 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 COQ9O75208 318 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MAGEA8P43361 318 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 NAMPTP43490 491 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 PKNOX1P55347 436 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MS4A2Q01362 244 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 CA9Q16790 459 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 PACS1Q6VY07 963 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MCUQ8NE86 351 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 PCDH19Q8TAB3 1148 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 IRGQQ8WZA9 623 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MOCOSQ96EN8 888 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 WNK4Q96J92 1243 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 TMEM165Q9HC07 324 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 MGAMO43451 1857 aa21.06■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 FAM58BPP0C7Q3 252 aa21.05■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 RALBP11234 206 aa21.05■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 FLOT2Q14254 428 aa21.05■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.05■□□□□ 0.96
PMS1-222ENST00000639501 KLHL35Q6PF15 583 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms