RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 STARD3Q14849 445 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 NUGGCQ68CJ6 796 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 PMS2CLQ68D20 193 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 SASS6Q6UVJ0 657 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 TAC4Q86UU9 113 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 C11orf74Q86VG3 221 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 UNC45BQ8IWX7 931 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEFF1Q8IYR6 380 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 SCML4Q8N228 414 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CPXM2Q8N436 756 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 NETO1Q8TDF5 533 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 SHC3Q92529 594 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 PIGKQ92643 395 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 LOXL4Q96JB6 756 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 SERPINB11Q96P15 392 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 NOX5Q96PH1 765 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 SIX2Q9NPC8 291 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCB8Q9NUT2 735 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 HCN2Q9UL51 889 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP83Q9Y592 693 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CAVIN2O95810 425 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 APOEP02649 317 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 SDHBP21912 280 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 P2RY2P41231 377 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 NUMBP49757 651 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 DCAF6Q58WW2 860 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 MIIPQ5JXC2 388 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 ADGRF1Q5T601 910 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 TAF3Q5VWG9 929 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 IL31Q6EBC2 164 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 OR6B2Q6IFH4 312 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CHST9Q7L1S5 443 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF34Q969K3 372 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CPXM1Q96SM3 734 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 VPS16Q9H269 839 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 NUP205Q92621 2012 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PQF6 199 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ACSL4O60488 711 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 EPHX1P07099 455 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF806P0C7X5 589 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 HLA-EP13747 358 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 PRKCHP24723 683 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC6A4P31645 630 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 IL12RB1P42701 662 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF445P59923 1031 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 CDH18Q13634 790 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF234Q14588 700 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 SYPL2Q5VXT5 272 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 CHSY1Q86X52 802 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 MFN1Q8IWA4 741 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM217AQ8IXS0 508 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF366Q8N895 744 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 EDEM2Q9BV94 578 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 POPDC2Q9HBU9 364 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 CD93Q9NPY3 652 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 VPS45Q9NRW7 570 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms