RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KDM5C	P41229	1560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A087X0M5	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GX30	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	EXOC5	O00471	708 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIAP1	O43715	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RECQL4	O94761	1208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GFPT2	O94808	682 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR47	O94967	919 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	LARGE1	O95461	756 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KLK10	O43240	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PEPD	P12955	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CPA1	P15085	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DRD1	P21728	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	NR4A1	P22736	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MCM2	P49736	904 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNT2	Q10471	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKG2	Q13237	762 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT32	Q14532	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	P3H1	Q32P28	736 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	STAM	Q92783	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF14	Q15058	1648 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM24	O15164	1050 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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