RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 NARSO43776 548 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ADH5P11766 374 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ADRA1BP35368 520 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 DHCR24Q15392 516 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 HADHQ16836 314 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 MS4A13Q5J8X5 152 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 MPP7Q5T2T1 576 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 C11orf63Q6NUN7 778 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SCYL2Q6P3W7 929 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 CHSY1Q86X52 802 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00597Q9H2U6 94 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 USP18Q9UMW8 372 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ARSAP15289 507 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 RABGAP1LQ5R372 815 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 OSBPL2Q9H1P3 480 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 GTSE1Q9NYZ3 720 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 RCCD1A6NED2 376 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 DCXO43602 365 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ALADP13716 330 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 TACR2P21452 398 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 MIPP30301 263 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 HTR7P34969 479 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 PRKCQQ04759 706 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 TNK2Q07912 1038 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 MESDQ14696 234 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 LY6G5CQ5SRR4 150 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 NADSYN1Q6IA69 706 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 RHBDF2Q6PJF5 856 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC31Q6UY01 552 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SHDQ96IW2 340 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 BTBD6Q96KE9 485 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 BBS2Q9BXC9 721 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 LACRTQ9GZZ8 138 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 KCNF1Q9H3M0 494 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 HS3ST4Q9Y661 456 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 GFRA2O00451 464 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 PENKP01210 267 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 BOLA3Q53S33 107 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ERMARDQ5T6L9 678 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 PIK3R6Q5UE93 754 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 RAP1GAP2Q684P5 730 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 POLNQ7Z5Q5 900 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC185Q8N715 623 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 TEKT4Q8WW24 435 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 RETREG1Q9H6L5 497 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 FBXL21Q9UKT6 434 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 FZD10Q9ULW2 581 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ZSCAN12O43309 604 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 CACNG3O60359 315 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 KRT7P08729 469 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SLC6A4P31645 630 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ZXDAP98168 799 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ANO4Q32M45 955 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 DDI1Q8WTU0 396 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SLC2A11Q9BYW1 496 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF3Q9NR81 526 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 AP4E1Q9UPM8 1137 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 PIAS3Q9Y6X2 628 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 MAN2B1O00754 1011 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 GJA4P35212 333 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SIGLEC14Q08ET2 396 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 AUHQ13825 339 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 C5orf22Q49AR2 442 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 RAB6CQ53S08 254 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 FYB2Q5VWT5 728 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 TPGS1Q6ZTW0 290 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM25Q86YD3 366 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SYCE1Q8N0S2 351 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 LGI2Q8N0V4 545 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 TPCN2Q8NHX9 752 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 EPAS1Q99814 870 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SIK2Q9H0K1 926 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 RAB6CQ9H0N0 254 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ANLNQ9NQW6 1124 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRK-218ENST00000525459 HEBP1Q9NRV9 189 aa19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms