RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 RAD9BQ6WBX8 426 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZNB5 142 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM25Q86YD3 366 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 FLCNQ8NFG4 579 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SHDQ96IW2 340 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 BTN2A3PQ96KV6 586 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM191CA6NGB0 347 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNU1A8MYU2 1149 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 F5H5T6 163 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MYO1FO00160 1098 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 AVPR2P30518 371 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 GGCXP38435 758 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 CXCR3P49682 368 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT83P78385 493 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 OGDHQ02218 1023 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 GAD2Q05329 585 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP2R5DQ14738 602 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 UBXN2BQ14CS0 331 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 BRMS1LQ5PSV4 323 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 RFWD3Q6PCD5 774 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 STRADAQ7RTN6 431 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 LGI2Q8N0V4 545 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA1958Q8N8K9 716 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 NAT16Q8N8M0 369 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ACRBPQ8NEB7 543 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 EXOC4Q96A65 974 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC39A13Q96H72 371 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 BTBD6Q96KE9 485 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 DESI2Q9BSY9 194 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TRIM7Q9C029 511 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PLK2Q9NYY3 685 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 STIM2Q9P246 746 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 WNT16Q9UBV4 365 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 IP6K2Q9UHH9 426 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 NENFQ9UMX5 172 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ARNTLO00327 626 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 GREM1O60565 184 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PAGE1O75459 146 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 LATS1O95835 1130 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TYRP14679 529 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 CD72P21854 359 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 FECHP22830 423 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 GJC1P36383 396 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 KDSRQ06136 332 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MTA1Q13330 715 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MPPE1Q53F39 396 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB6CQ53S08 254 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF852Q6ZMS4 543 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TXLNBQ8N3L3 684 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC35G2Q8TBE7 412 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM3CQ92520 227 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 NT5C3BQ969T7 300 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAM33Q9BZ11 813 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB6CQ9H0N0 254 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM51Q9NW97 253 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 UVRAGQ9P2Y5 699 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PCSK1NQ9UHG2 260 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TFR2Q9UP52 801 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MAN2B1O00754 1011 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PRPSAP2O60256 369 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TBL1XO60907 577 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SRGAP2O75044 1071 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TACR2P21452 398 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC6A4P31645 630 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 CTHP32929 405 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 GJA4P35212 333 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 HDAC4P56524 1084 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PRKCQQ04759 706 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MESDQ14696 234 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PON2Q15165 354 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 EFHC2Q5JST6 749 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 RABGAP1LQ5R372 815 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 NADSYN1Q6IA69 706 aa13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms