RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KITP10721 976 aa16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYBAP13498 195 aa16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SESN3P58005 492 aa16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BLMHQ13867 455 aa16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAF11Q15544 211 aa16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFX8Q6ZV50 586 aa16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TDRPQ86YL5 185 aa16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEKT4Q8WW24 435 aa16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E7ENQ6 273 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM72CH0Y354 149 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GALT3O60512 393 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPA1O75762 1119 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TKTL1P51854 596 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KYAT1Q16773 422 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM72AQ5TYM5 149 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM72DQ6L9T8 149 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASRGL1Q7L266 308 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM72BQ86X60 149 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C10orf82Q8WW14 230 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCED1BQ96HM7 432 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B3GALT6Q96L58 329 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPV6Q9H1D0 765 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HCSTQ9UBK5 93 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 M0QYT0 321 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBED1O96006 694 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCAT1P54687 386 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF560Q96MR9 790 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYTH2Q99418 400 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAM2Q99965 735 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSAD1Q9HA92 442 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SENP1Q9P0U3 644 aa16.01■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 I6L893 689 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD4P01730 458 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THP07101 528 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPA2P48052 419 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFN1Q8IWA4 741 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC4Q9HBW1 653 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEY2Q9UBP5 337 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF232Q9UNY5 417 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UNCXA6NJT0 531 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM49D1C9J1S8 452 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOL1O14791 398 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL18O95568 372 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BDNFP23560 247 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGFP49763 221 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SV2CQ496J9 727 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRD1Q6QNK2 874 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC8Q8TAM2 541 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR152Q8TDT2 470 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KATNAL1Q9BW62 490 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM4Q9C037 500 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMLHEQ9NVH6 421 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTMR10Q9NXD2 777 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARMCX1Q9P291 453 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TET1Q8NFU7 2136 aa16■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC78A2IDD5 438 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENTPD5O75356 428 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 T-ENOLP0DO92 83 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 L1CAMP32004 1257 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PBX3P40426 434 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOMO1Q15155 1222 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNT2Q6UVM3 1135 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPP5Q8N3R9 675 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIGVQ9NUD9 493 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPV2Q9Y5S1 764 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E2F8A0AVK6 867 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms