RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 PCDHGB4Q9UN71 923 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PSAT1Q9Y617 370 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 DCXO43602 365 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 TFAP2AP05549 437 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 CXCL8P10145 99 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 COX4I1P13073 169 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 GRK2P25098 689 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 GMPRP36959 345 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 CRADDP78560 199 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 GBE1Q04446 702 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 SEMA5AQ13591 1074 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 DPH6Q7L8W6 267 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 RNF149Q8NC42 400 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 DCUN1D1Q96GG9 259 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 HIC2Q96JB3 615 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 UBAP1Q9NZ09 502 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM216Q9P0N5 145 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 COPG2Q9UBF2 871 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 TMCO1Q9UM00 188 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 DTNAQ9Y4J8 743 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 NFICP08651 508 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 RGS2P41220 211 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 OAZ1P54368 228 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ITGA9Q13797 1035 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 PPM1JQ5JR12 505 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 CXorf38Q8TB03 319 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF670Q9BS34 389 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 NRBP2Q9NSY0 501 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 B4GALT5O43286 388 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 DNAJA2O60884 412 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 FBXO21O94952 628 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 PFKMP08237 780 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ITGA2BP08514 1039 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 RALBP11234 206 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 VDRP11473 427 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 CD1EP15812 388 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 CYP2F1P24903 491 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 PRDX6P30041 224 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 MAP7Q14244 749 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 STILQ15468 1287 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 EEF1DP3Q658K8 133 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ATP2A3Q93084 1043 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ACAD9Q9H845 621 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 MAN1C1Q9NR34 630 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 PTTG2Q9NZH5 202 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 HSFX1Q9UBD0 423 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 PSMD13Q9UNM6 376 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.64□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 DPYSL4O14531 572 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ITGB3P05106 788 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 PMLP29590 882 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 BACE1P56817 501 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 STXBP2Q15833 593 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 JDP2Q8WYK2 163 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 KCNK16Q96T55 309 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 RTKNQ9BST9 563 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 COG4Q9H9E3 785 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 MTMR10Q9NXD2 777 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 EVPLQ92817 2033 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 MDM4O15151 490 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 STAT5BP51692 787 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 USP4Q13107 963 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 KLF10Q13118 480 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 INSCQ1MX18 579 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ATF7IP2Q5U623 682 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 IER5Q5VY09 327 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 EPGNQ6UW88 154 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ISLR2Q6UXK2 745 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 LCA5Q86VQ0 697 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 LRRC71Q8N4P6 559 aa10.63□□□□□ -0.71
LINC00886-201ENST00000472943 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms