RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	WASH3P	C4AMC7	463 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	PIK3R2	O00459	728 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP33	O14559	1287 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO21	O94952	628 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	LTF	P02788	710 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM193A	P78312	1265 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	MPPE1	Q53F39	396 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	DDI1	Q8WTU0	396 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	RAD54B	Q9Y620	910 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF4	O00268	1085 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF217	O75362	1048 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	CAPNS1	P04632	268 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	FYN	P06241	537 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	SYP	P08247	313 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	CD59	P13987	128 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	IL12RB1	P42701	662 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRF1	Q5T601	910 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM215	Q68D42	235 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT5	P13647	590 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	MLKL	Q8NB16	471 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	STK32A	Q8WU08	396 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	UCMA	Q8WVF2	138 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	AZIN2	Q96A70	460 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM81B	Q96LP2	452 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	ACACA	Q13085	2346 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MRPL28-203	ENST00000429738	LAMA5	O15230	3695 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	BECN2	A8MW95	431 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC9A1	P19634	815 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-F	P30511	346 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ACADSB	P45954	432 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC14A1	Q13336	389 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	NNT	Q13423	1086 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF234	Q14588	700 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	E2F5	Q15329	346 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	FUT11	Q495W5	492 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	GJB7	Q6PEY0	223 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	BEND5	Q7L4P6	421 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PROSER1	Q86XN7	944 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	MIS12	Q9H081	205 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ACP6	Q9NPH0	428 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CD93	Q9NPY3	652 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	MED7	O43513	233 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM44	O43615	452 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPAN3	O60637	253 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	NCAM1	P13591	858 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	GNA15	P30679	374 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SGSH	P51688	502 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TBX4	P57082	545 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	MPP7	Q5T2T1	576 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	GBP6	Q6ZN66	633 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM110	Q86TL2	294 aa		18.44	■□□□□ 0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms