RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 FANCLQ9NW38 375 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 NCOR2Q9Y618 2525 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 FAM170AA1A519 330 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 F8VZ95 297 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 TBL1XO60907 577 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 GRAP2O75791 330 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 RHOBTB1O94844 696 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CYP11B1P15538 503 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PRKCHP24723 683 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PTGER3P43115 390 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ZNF445P59923 1031 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CREB5Q02930 508 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 NCAPHQ15003 741 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 FUT11Q495W5 492 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PGBD3Q8N328 593 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 NETO1Q8TDF5 533 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MRGPRX1Q96LB2 322 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 VPS16Q9H269 839 aa16.07■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PATE3B3GLJ2 98 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CAPN9O14815 690 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CD70P32970 193 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 SLC11A2P49281 568 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 STX1AQ16623 288 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PTPRNQ16849 979 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MPP7Q5T2T1 576 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CHST9Q7L1S5 443 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ERMP1Q7Z2K6 904 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 C11orf74Q86VG3 221 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 DEFB106AQ8N104 65 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CIPCQ9C0C6 399 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 GGA2Q9UJY4 613 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PI4KAP42356 2102 aa16.06■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 SLC30A4O14863 429 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 HLA-EP13747 358 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ZNF18P17022 549 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 COPAP53621 1224 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 DCAF6Q58WW2 860 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 TAF3Q5VWG9 929 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 SDE2Q6IQ49 451 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ARMCX6Q7L4S7 300 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 SPACA7Q96KW9 195 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 VPS45Q9NRW7 570 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CYP8B1Q9UNU6 501 aa16.05■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 DCDC2BA2VCK2 349 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 NPC1O15118 1278 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 HSF2BPO75031 334 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 DAB1O75553 588 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 CAVIN2O95810 425 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MBD3O95983 291 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 GLI1P08151 1106 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 KRT9P35527 623 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 JAM2P57087 298 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MYL5Q02045 173 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 LMAN2Q12907 356 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 C2CD6Q53TS8 623 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 FSCBQ5H9T9 825 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.04■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms