RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299084.8

SPRED1-201, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRED1, Length 7,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1-201ENST00000299084 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 MROH9Q5TGP6 573 aa14.68□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TSPAN3O60637 253 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 RUBCNQ92622 972 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ZBTB14O43829 449 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 S100A6P06703 90 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 STARP49675 285 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 VAC14Q08AM6 782 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 STK4Q13043 487 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TFPIP10646 304 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 SLC2A4P14672 509 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ATP1A4Q13733 1029 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 GSAPA4D1B5 854 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ATP9AO75110 1047 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 PEX14O75381 377 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 GIMD1P0DJR0 217 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TXNRD1Q16881 649 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 PIF1Q9H611 641 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 NCK2O43639 380 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 KATNA1O75449 491 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 GTF2H1P32780 548 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 PSEN2P49810 448 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TAB1Q15750 504 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 KLHL35Q6PF15 583 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 CEP44Q9C0F1 390 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 FAM20BO75063 409 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ATG7O95352 703 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ZNF846Q147U1 533 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 PRDX5P30044 214 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 OR1E1P30953 314 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 SLC7A2P52569 658 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 RAB25P57735 213 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TEAD4Q15561 434 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 RETSATQ6NUM9 610 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 CPVLQ9H3G5 476 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 RPTORQ8N122 1335 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TNFRSF21O75509 655 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 PAX3P23760 479 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ARID5BQ14865 1188 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 GPAT3Q53EU6 434 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 CD302Q8IX05 232 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 SGCDQ92629 289 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 GPER1Q99527 375 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 KCND2Q9NZV8 630 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TEX46H3BTG2 121 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 CYB5AP00167 134 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 ALOX12P18054 663 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 NOS2P35228 1153 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED1-201ENST00000299084 BCL2L1Q07817 233 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms