RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 CEP57Q86XR8 500 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR65Q8IYL9 337 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CPT1BQ92523 772 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 EDEM1Q92611 657 aa9.86□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PGM2Q96G03 612 aa9.86□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 WDCPQ9H6R7 721 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CWH43Q9H720 699 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DTLQ9NZJ0 730 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MTRRQ9UBK8 725 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CEP350Q5VT06 3117 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MTMR11A4FU01 709 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 I6L893 689 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 AMHP03971 560 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RBL1P28749 1068 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HOXC13P31276 330 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ACTN2P35609 894 aa9.85□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 GCGRP47871 477 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GLUD2P49448 558 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ARL4CP56559 192 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SKOR1P84550 965 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MTA1Q13330 715 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNJ11Q14654 390 aa9.85□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 KRT71Q3SY84 523 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.85□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.85□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC25Q86WR0 208 aa9.85□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.85□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 IGSF21Q96ID5 467 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINB11Q96P15 392 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGEB5Q9BZ81 275 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ANLNQ9NQW6 1124 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC3P53804 2025 aa9.85□□□□□ -0.83
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APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PQH9 124 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM72CH0Y354 149 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 BAIAP3O94812 1187 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 VNN2O95498 520 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SHBGP04278 402 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC2A3P11169 496 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CPB1P15086 417 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ERCC2P18074 760 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MX2P20592 715 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 YWHAQP27348 245 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CCR1P32246 355 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CDR1P51861 262 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TPI1P60174 286 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF33AQ06730 810 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 STAT4Q14765 748 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RASA2Q15283 850 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HIF1AQ16665 826 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 KYNUQ16719 465 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DDR2Q16832 855 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM72AQ5TYM5 149 aa9.84□□□□□ -0.83
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