RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619644.4

SMTN-223, Transcript of smoothelin, human

TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-223	ENST00000619644	USP6NL	Q92738	828 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	KIF12	Q96FN5	646 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	WDR27	A2RRH5	827 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CYP2F1	P24903	491 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ADORA2B	P29275	332 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GRM1	Q13255	1194 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PPP2R5D	Q14738	602 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CES4A	Q5XG92	561 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SATL1	Q86VE3	508 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CCNY	Q8ND76	341 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	NLRP7	Q8WX94	980 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	RFPL1	O75677	317 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	OR6B1	O95007	311 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PDGFRB	P09619	1106 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	IMPDH2	P12268	514 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CYP3A5	P20815	502 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PHKA2	P46019	1235 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PDSS2	Q86YH6	399 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	KLRG1	Q96E93	195 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GPR20	Q99678	358 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	HESX1	Q9UBX0	185 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	MED21	Q13503	144 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PEX6	Q13608	980 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	MAP7	Q14244	749 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PQLC3	Q8N755	202 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	MPP4	Q96JB8	637 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	BCO2	Q9BYV7	579 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GPAM	Q9HCL2	828 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	EVPL	Q92817	2033 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	HCRT	O43612	131 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PDE5A	O76074	875 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	IL18RAP	O95256	599 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ASL	P04424	464 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FAM200B	P0CF97	657 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	BOLA3	Q53S33	107 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SFT2D3	Q587I9	215 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DPP3	Q9NY33	737 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ABCG1	P45844	678 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DEUP1	Q05D60	604 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TAZ	Q16635	292 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ITM2A	O43736	263 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ZMPSTE24	O75844	475 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	IL4R	P24394	825 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ADORA2A	P29274	412 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	OTUD5	Q96G74	571 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	AGAP3	Q96P47	875 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	LGMN	Q99538	433 aa		14.9	□□□□□ -0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms