RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa18.34■□□□□ 0.53
ZNF548-204ENST00000594693 COX16Q9P0S2 106 aa18.34■□□□□ 0.53
ZNF548-204ENST00000594693 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
ZNF548-204ENST00000594693 GFRA2O00451 464 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CCP110O43303 1012 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ACSL4O60488 711 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 NFATC1O95644 943 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 APOEP02649 317 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 GLULP15104 373 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CHKAP35790 457 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 HDAC4P56524 1084 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MTA1Q13330 715 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TCEAL1Q15170 157 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 DHCR24Q15392 516 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 BRMS1LQ5PSV4 323 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM25Q86YD3 366 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CPXM2Q8N436 756 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 FAM172AQ8WUF8 416 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 RNF34Q969K3 372 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 BTN2A3PQ96KV6 586 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SPHK2Q9NRA0 654 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 UVRAGQ9P2Y5 699 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MUC3AQ02505 3323 aa18.33■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 BDP1A6H8Y1 2624 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 I6L893 689 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TNFRSF10AO00220 468 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PSMA2P25787 234 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 NR1H3Q13133 447 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ACAP1Q15027 740 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 LY6G5CQ5SRR4 150 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 NADSYN1Q6IA69 706 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CPA6Q8N4T0 437 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC112Q8NEF3 446 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TKTL2Q9H0I9 626 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ANLNQ9NQW6 1124 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa18.32■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SHISA7A6NL88 538 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CYP17A1P05093 508 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CDO1Q16878 200 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 GAB4Q2WGN9 574 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TTC8Q8TAM2 541 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CHFRQ96EP1 664 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 P2RY11Q96G91 374 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 C1orf74Q96LT6 269 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MARK1Q9P0L2 795 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa18.31■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TRIOO75962 3097 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 KRBA1A5PL33 1030 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MYO1FO00160 1098 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PAGE1O75459 146 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MTA2O94776 668 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ADH1CP00326 375 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SLC6A4P31645 630 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 GJA4P35212 333 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ADRA1BP35368 520 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PRKCQQ04759 706 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 GAD2Q05329 585 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 FAM131BQ86XD5 332 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 RHOT2Q8IXI1 618 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 NIPA2Q8N8Q9 360 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 HAPLN3Q96S86 360 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 OSGEPQ9NPF4 335 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 IP6K2Q9UHH9 426 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ANAPC7Q9UJX3 599 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.3■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 RCCD1A6NED2 376 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ARHGAP6O43182 974 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 DESP17661 470 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SOX9P48436 509 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 STARD6P59095 220 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 KRT83P78385 493 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MS4A13Q5J8X5 152 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms