RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS19P49795 217 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCY2Q08462 1091 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MMRN1Q13201 1228 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CSPG4P5Q96PW8 444 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 EPAS1Q99814 870 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 IL21Q9HBE4 155 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO9BQ13459 2157 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CSPG5O95196 566 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 PFKLP17858 780 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC25CP30307 473 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 COILP38432 576 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC1Q9BTT6 524 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NACA2Q9H009 215 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 APOL1O14791 398 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 OAS1P00973 400 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 COG7P83436 770 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NUGGCQ68CJ6 796 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TMC8Q8IU68 726 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC45BQ8IWX7 931 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PYROXD2Q8N2H3 581 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 LEMD2Q8NC56 503 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDH19Q8TAB3 1148 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GRK7Q8WTQ7 553 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 SLCO2A1Q92959 643 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf74Q96LT6 269 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC3Q9BY71 257 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CERS4Q9HA82 394 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ANLNQ9NQW6 1124 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 OR12D3Q9UGF7 316 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK6Q96HP0 2047 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC12A8A0AV02 714 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 I6L893 689 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TBX18O95935 607 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 LMNB2Q03252 620 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ELF2Q15723 593 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM150AQ86TG1 271 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 BTN2A3PQ96KV6 586 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GCNAQ96QF7 691 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ASAH2Q9NR71 780 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CLUHO75153 1309 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 XYLBO75191 536 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOXF2BP0C7M4 288 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GOT1P17174 413 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MCM3P25205 808 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MIB1Q86YT6 1006 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PQLC3Q8N755 202 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf54Q8WWF1 131 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R3CQ969Q6 453 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TIFAQ96CG3 184 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOXF2Q9BQY4 288 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 AMACRQ9UHK6 382 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM187AA6NFU0 413 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 COCHO43405 550 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PAGE1O75459 146 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 EPCAMP16422 314 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRR2P28476 465 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NR2C2P49116 596 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 EPHA5P54756 1037 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TPI1P60174 286 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 RFX8Q6ZV50 586 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC105Q8IYK2 499 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ATL2Q8NHH9 583 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 P3H4Q92791 437 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PLD4Q96BZ4 506 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TLE6Q9H808 572 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD51CO43502 376 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CREB3O43889 395 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPN2P17706 415 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNLT1P63172 113 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DR1Q01658 176 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP6Q16828 381 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PLD5Q8N7P1 536 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTL9Q8TC94 416 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GDPD5Q8WTR4 605 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 STIM2Q9P246 746 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NOTCH4Q99466 2003 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CHD9Q3L8U1 2897 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 SOBPA7XYQ1 873 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL16O15467 120 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 LIASO43766 372 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 OLFM2O95897 454 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
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