RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	EBF3	Q9H4W6	596 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	PIGV	Q9NUD9	493 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MARK1	Q9P0L2	795 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	F5	P12259	2224 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	GFRA2	O00451	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ADH1C	P00326	375 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	CYP17A1	P05093	508 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ARSA	P15289	507 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MAGEA1	P43355	309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	TNK2	Q07912	1038 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	NME3	Q13232	169 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ACAP1	Q15027	740 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	TCEAL1	Q15170	157 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	DHCR24	Q15392	516 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	SPA17	Q15506	151 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	RNF34	Q969K3	372 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	SHD	Q96IW2	340 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	WDCP	Q9H6R7	721 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MAN2B1	O00754	1011 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	CCP110	O43303	1012 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	HDAC4	P56524	1084 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	STARD6	P59095	220 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ATP11A	P98196	1134 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	GAD2	Q05329	585 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	EXOC4	Q96A65	974 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	C1orf74	Q96LT6	269 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	NUP85	Q9BW27	656 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	COX16	Q9P0S2	106 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	TECTA	O75443	2155 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	KRBA1	A5PL33	1030 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MYO1F	O00160	1098 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	RNF8	O76064	485 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MTA2	O94776	668 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	CYBB	P04839	570 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ADH5	P11766	374 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	PSMA2	P25787	234 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	GJA4	P35212	333 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	AIF1	P55008	147 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	KRT83	P78385	493 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	OGDH	Q02218	1023 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	CDO1	Q16878	200 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MPPE1	Q53F39	396 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	MPP7	Q5T2T1	576 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM25	Q86YD3	366 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	RFFL	Q8WZ73	363 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	NTAN1	Q96AB6	310 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	HAPLN3	Q96S86	360 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	TRIM7	Q9C029	511 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	CA14	Q9ULX7	337 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0C4DFX4	3053 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PKN1-208	ENST00000586900	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGAP6	O43182	974 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKN1-208	ENST00000586900	NRDC	O43847	1150 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKN1-208	ENST00000586900	PAGE1	O75459	146 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKN1-208	ENST00000586900	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37

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