RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557652.1

SUPT16H-208, Transcript of SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit, humanhuman

TSL 5

Gene SUPT16H, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16H-208ENST00000557652 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.66□□□□□ -0.06
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SUPT16H-208ENST00000557652 SHDQ96IW2 340 aa14.63□□□□□ -0.07
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SUPT16H-208ENST00000557652 GJB6O95452 261 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 HMBSP08397 361 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 ADRA1BP35368 520 aa14.62□□□□□ -0.07
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SUPT16H-208ENST00000557652 E2F5Q15329 346 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 CDO1Q16878 200 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 C5orf22Q49AR2 442 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 EFHC2Q5JST6 749 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 LRRC31Q6UY01 552 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 RIN3Q8TB24 985 aa14.62□□□□□ -0.07
SUPT16H-208ENST00000557652 TEKT4Q8WW24 435 aa14.62□□□□□ -0.07
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