RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	APOL5	Q9BWW9	433 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TLR9	Q9NR96	1032 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	LACTBL1	A8MY62	500 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TISP43	B9A030	160 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288		I3L4J1	428 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	MAN2B1	O00754	1011 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CLIC2	O15247	247 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TOM1L1	O75674	476 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	LRG1	P02750	347 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	GALT	P07902	379 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA31D3	P0C874	917 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	MCF2	P10911	925 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNA5	P22460	613 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	KLRC2	P26717	231 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PPM1A	P35813	382 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFSF9	P41273	254 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFV1	P49821	464 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	EPHA5	P54756	1037 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ARPP19	P56211	112 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TFF2	Q03403	129 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	COASY	Q13057	564 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	POSTN	Q15063	836 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM177	Q53S58	311 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PALB2	Q86YC2	1186 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NINJ1	Q92982	152 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	P2RX5	Q93086	422 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SAAL1	Q96ER3	474 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	B3GALT6	Q96L58	329 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NOX5	Q96PH1	765 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TCF25	Q9BQ70	676 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CDT1	Q9H211	546 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TNMD	Q9H2S6	317 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CUEDC2	Q9H467	287 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	EXOC1	Q9NV70	894 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HIDE1	A8MVS5	230 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288		B8ZZF3	427 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288		F8W810	466 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	OGT	O15294	1046 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01565	O15544	149 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	B3GAT3	O94766	335 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT19	P08727	400 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CLTA	P09496	248 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	JMJD7	P0C870	316 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CXCL8	P10145	99 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FAH	P16930	419 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD3B2	P26439	372 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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