RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542011.1

VSIG10-208, Transcript of V-set and immunoglobulin domain containing 10, human

TSL 3

Gene VSIG10, Length 572 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	HCN2	Q9UL51	889 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	GDF9	O60383	454 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ACSL4	O60488	711 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ASL	P04424	464 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	HMBS	P08397	361 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SERPINF2	P08697	491 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC2A3	P11169	496 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	NCAM1	P13591	858 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	KRT5	P13647	590 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	LCP1	P13796	627 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	GNS	P15586	552 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	NDUFV2	P19404	249 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	HOXC13	P31276	330 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	OXCT1	P55809	520 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SHC2	P98077	582 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	GEN1	Q17RS7	908 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	RRAGA	Q7L523	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PIGK	Q92643	395 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	LHX5	Q9H2C1	402 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SUN2	Q9UH99	717 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	LNP1	A1A4G5	178 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TRIM24	O15164	1050 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	NDUFS2	O75306	463 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	APOE	P02649	317 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SYP	P08247	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	CEACAM1	P13688	526 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	CD6	P30203	668 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	GNA15	P30679	374 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	STX17	P56962	302 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TBX4	P57082	545 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PTK2	Q05397	1052 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ZNF33A	Q06730	810 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC14A1	Q13336	389 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC12A1	Q13621	1099 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	MAN2A1	Q16706	1144 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	OR2T3	Q8NH03	318 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	RLN3	Q8WXF3	142 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SHC3	Q92529	594 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	EDEM1	Q92611	657 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	KAT5	Q92993	513 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC39A13	Q96H72	371 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	NUP58	Q9BVL2	599 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	MIS12	Q9H081	205 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	TMEM245	Q9H330	911 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	PLK2	Q9NYY3	685 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VSIG10-208	ENST00000542011	SCML1	Q9UN30	329 aa		10.09	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms