RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 GID8Q9NWU2 228 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 STK39Q9UEW8 545 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 SNX8Q9Y5X2 465 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 TOMM70O94826 608 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 SUPT7LO94864 414 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 PAEPP09466 180 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 IMPDH2P12268 514 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 GLRA2P23416 452 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 GPR1P46091 355 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 RHBDL3P58872 404 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 AP2B1P63010 937 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 COL1A2P08123 1366 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 EML1O00423 815 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 CYTH3O43739 400 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 HTR1BP28222 390 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 MMP13P45452 471 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 C16orf89Q6UX73 402 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 RBBP8Q99708 897 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 IL25Q9H293 177 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 PPCSQ9HAB8 311 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 NPHS2Q9NP85 383 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 NFICP08651 508 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 KCNJ1P48048 391 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 CASP10Q92851 521 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 RHBGQ9H310 441 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 USP27XA6NNY8 438 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FAM107AO95990 144 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 SKP1P63208 163 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 MAP3K10Q02779 954 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 POU6F1Q14863 301 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 CHI3L2Q15782 390 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FUT11Q495W5 492 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 AHSPQ9NZD4 102 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 CCL5P13501 91 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 PSEN1P49768 467 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 CRHR2Q13324 411 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 PEX6Q13608 980 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 DDR2Q16832 855 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 LZTR1Q8N653 840 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 OR8D1Q8WZ84 308 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 LENG9Q96B70 501 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM51Q9NW97 253 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 NUDT14O95848 222 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PAX3P23760 479 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SLC12A3P55017 1021 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SKOR1P84550 965 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MYBPC2Q14324 1141 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 NFIL3Q16649 462 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CCNJLQ8IV13 435 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SIX5Q8N196 739 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RUBCNQ92622 972 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GLMNQ92990 594 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MYOCQ99972 504 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 BTBD7Q9P203 1132 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 AKAP3O75969 853 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RRM1P23921 792 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GLRBP48167 497 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ALFQ53S48 1182 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 IFNEQ86WN2 208 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SEPT3Q9UH03 358 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 F8VZ95 297 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 O00370 1275 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DGKIO75912 1065 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 AGTP01019 485 aa9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms