RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516896.1

RNU6-175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-175P-201ENST00000516896 RAX2Q96IS3 184 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 C18orf12Q96KH6 178 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 AGAP3Q96P47 875 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 C7orf25Q9BPX7 421 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 VKORC1Q9BQB6 163 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 MGME1Q9BQP7 344 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 PTDSS2Q9BVG9 487 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 TANGO6Q9C0B7 1094 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 PIF1Q9H611 641 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 TCF7L1Q9HCS4 588 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 DMRT3Q9NQL9 472 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 TDP1Q9NUW8 608 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ETAA1Q9NY74 926 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 TAAR2Q9P1P5 351 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CFAP97Q9P2B7 532 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 USP35Q9P2H5 1018 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 THEGQ9P2T0 379 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 GABBR1Q9UBS5 961 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 POMT2Q9UKY4 750 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 GABRQQ9UN88 632 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CDC14AQ9UNH5 594 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 USP22Q9UPT9 525 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 LAMP3Q9UQV4 416 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CSAG2Q9Y5P2 127 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ATRXP46100 2492 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 FBN3Q75N90 2809 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CLEC18AA5D8T8 446 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 GAGE12JA6NER3 117 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CCDC85CA6NKD9 419 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 TTC34A8MYJ7 566 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 H0Y9J4 135 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 MS4A18H0YCH9 400 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 hCG_1984214I3L0E3 225 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 NR5A2O00482 541 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 PSMD14O00487 310 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 DVL1O14640 695 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 RRHO14718 337 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 HAT1O14929 419 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 DCXO43602 365 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 PCDH7O60245 1069 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ASLP04424 464 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 AMY1AP04745 511 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 JMJD7P0C870 316 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 RXRAP19793 462 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 SMARCA1P28370 1054 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 PPIFP30405 207 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 PRKAR1BP31321 381 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CYP2C19P33261 490 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 AMTP48728 403 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 FMO5P49326 533 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 JAK3P52333 1124 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 NUDT6P53370 316 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 LOXL3P58215 753 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 LILRA4P59901 499 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 KRTAP12-4P60329 112 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZP1P60852 638 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 FANCCQ00597 558 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CFHR3Q02985 330 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZBTB16Q05516 673 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 NFATC2Q13469 925 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 TMEM187Q14656 261 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 IQCB1Q15051 598 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 SHHQ15465 462 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 FAM189A2Q15884 450 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 ADRM1Q16186 407 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 SYT16Q17RD7 645 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 SNAI3Q3KNW1 292 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CFAP100Q494V2 611 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 LONRF3Q496Y0 759 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 FLYWCH1Q4VC44 716 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 CCDC93Q567U6 631 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 EFHC1Q5JVL4 640 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 FHL5Q5TD97 284 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-175P-201ENST00000516896 LIPMQ5VYY2 423 aa0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms