RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465894.6

SH3BP5-209, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-209ENST00000465894 LEMD2Q8NC56 503 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 SLC39A13Q96H72 371 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 RNF157Q96PX1 679 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 CORO1BQ9BR76 489 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF670Q9BS34 389 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 AP1M1Q9BXS5 423 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 PARD6BQ9BYG5 372 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF576Q9H609 170 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 HOMER3Q9NSC5 361 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP5-209ENST00000465894 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 KCNU1A8MYU2 1149 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 H3BRJ5 948 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 COCHO43405 550 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 RFPL2O75678 378 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 OAS1P00973 400 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 APOEP02649 317 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 MYL4P12829 197 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 PFKLP17858 780 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 IL4RP24394 825 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 HCAR3P49019 387 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 RING1Q06587 406 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 C2orf54Q08AI8 447 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 MMRN1Q13201 1228 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 LRIT3Q3SXY7 679 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 GAREM2Q75VX8 874 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 LRRN4CLQ8ND94 238 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 MYO9BQ13459 2157 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 DAPK3O43293 454 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 CST8O60676 142 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 IGLV3-27P01718 113 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 HMBSP08397 361 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 HDCP19113 662 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 EPHA5P54756 1037 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 NUGGCQ68CJ6 796 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 BBS12Q6ZW61 710 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 TTC13Q8NBP0 860 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 FAF2Q96CS3 445 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 BTN2A3PQ96KV6 586 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 C1orf74Q96LT6 269 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 EPAS1Q99814 870 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 HERPUD2Q9BSE4 406 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 MAGEB5Q9BZ81 275 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 RNF38Q9H0F5 515 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 IGFLR1Q9H665 355 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 TRPC7Q9HCX4 862 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ANLNQ9NQW6 1124 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 DZANK1Q9NVP4 752 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF446Q9NWS9 450 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 LMCD1Q9NZU5 365 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 STIM2Q9P246 746 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 OR12D3Q9UGF7 316 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 DENND4CQ5VZ89 1909 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 C2orf78A6NCI8 922 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 SOBPA7XYQ1 873 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF197O14709 1029 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 APOL1O14791 398 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 CREB3O43889 395 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 PAGE1O75459 146 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 RHOP08100 348 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 HTR7P34969 479 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 CCNG2Q16589 344 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 CYP1B1Q16678 543 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF697Q5TEC3 545 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 TXNDC8Q6A555 127 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 HDXQ7Z353 690 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP5-209ENST00000465894 KLHL7Q8IXQ5 586 aa13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms