RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 TNFRSF4P43489 277 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 DGKGP49619 791 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 CENPCQ03188 943 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 FYB2Q5VWT5 728 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.154e-7■□□□□ 11.3
ABCD4-202ENST00000460308 A0A0A0MRY4 1105 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 K7EQS6 105 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 M0QYT0 321 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 IGLV3-25P01717 112 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 CALB1P05937 261 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SP9P0CG40 484 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 CCR1P32246 355 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SATB1Q01826 763 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 NME3Q13232 169 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 C2orf27AQ580R0 203 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 CACNA1HO95180 2353 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ABCB4P21439 1286 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SULT1E1P49888 294 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TSSK4Q6SA08 328 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TERB1Q8NA31 727 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ACDQ96AP0 544 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM51Q9NW97 253 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TRIM24O15164 1050 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 F9P00740 461 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TIE1P35590 1138 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PRKCIP41743 596 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 NRLP54845 237 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ZBED6P86452 979 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 NHLH1Q02575 133 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 MESP2Q0VG99 397 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 MTA1Q13330 715 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 USP33Q8TEY7 942 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 FAM122AQ96E09 287 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 NPY6RQ99463 290 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 FBXO10Q9UK96 956 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 CISD3P0C7P0 127 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SKILP12757 684 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 DEUP1Q05D60 604 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ARCQ7LC44 396 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TBL1XO60907 577 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 KRT3P12035 628 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 SLC6A4P31645 630 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 FLT3P36888 993 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 PTP4A2Q12974 167 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 EMC10Q5UCC4 262 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 NADSYN1Q6IA69 706 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 CHSY1Q86X52 802 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCD4-202ENST00000460308 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.21■■□□□ 1.15
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