RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439578.5

SAR1B-202, Transcript of secretion associated Ras related GTPase 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAR1B, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1B-202ENST00000439578 VITQ6UXI7 678 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 HTR3DQ70Z44 454 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CHSY1Q86X52 802 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 DENND1CQ8IV53 801 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 UBALD2Q8IYN6 164 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 DNASE1L2Q92874 299 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 NPY6RQ99463 290 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 DESI2Q9BSY9 194 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 F5H5T6 163 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SPOPO43791 374 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FYNP06241 537 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SRFP11831 508 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FCARP24071 287 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 MESDQ14696 234 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ANO4Q32M45 955 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FAM131BQ86XD5 332 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM139Q8IV31 216 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 DDI1Q8WTU0 396 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 AZIN2Q96A70 460 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 MSANTD3Q96H12 275 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 NENFQ9UMX5 172 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 WNT6Q9Y6F9 365 aa11.1□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 DENND4CQ5VZ89 1909 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ACSL4O60488 711 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 IGLV3-25P01717 112 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ASGR2P07307 311 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 KRT7P08729 469 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 MAN1A1P33908 653 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PCK1P35558 622 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SLC1A1P43005 524 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CXCR3P49682 368 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CCZ1BP86790 482 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 GAD2Q05329 585 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 MPPE1Q53F39 396 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ADGRF1Q5T601 910 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 DAAM2Q86T65 1068 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 RNF135Q8IUD6 432 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 NT5C3BQ969T7 300 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PIGVQ9NUD9 493 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 STIM2Q9P246 746 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 NOTCH4Q99466 2003 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.09□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 DAPK3O43293 454 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 PROSCO94903 275 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 ENDOD1O94919 500 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 ADH5P11766 374 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 RUNX3Q13761 415 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 KRT81Q14533 505 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 BOLA3Q53S33 107 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 ARSIQ5FYB1 569 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 CPXM2Q8N436 756 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 NTAN1Q96AB6 310 aa11.08□□□□□ -0.64
SAR1B-202ENST00000439578 SLC39A13Q96H72 371 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms