RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PI4KAP42356 2102 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CLUHO75153 1309 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NEDD4P46934 1319 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 KANSL1LA0AUZ9 987 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ATP9AO75110 1047 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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PTPRK-210ENST00000415055 VTNP04004 478 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PROS1P07225 676 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CTSAP10619 480 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 RHCEP18577 417 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CD72P21854 359 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 KLRC1P26715 233 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FAM193AP78312 1265 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 RHDQ02161 417 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GRIN1Q05586 938 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 RAPGEF1Q13905 1077 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CLLU1OSQ5K130 101 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 BTBD8Q5XKL5 378 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FAM228AQ86W67 206 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ECHDC2Q86YB7 292 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PRR18Q8N4B5 295 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PHKBQ93100 1093 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CDHR1Q96JP9 859 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PIGSQ96S52 555 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 UBAC1Q9BSL1 405 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MYL10Q9BUA6 226 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZBP1Q9H171 429 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 EPC1Q9H2F5 836 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MYOTQ9UBF9 498 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SHROOM3Q8TF72 1996 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TTC41PQ6P2S7 1318 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FAM227AF5H4B4 570 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF213O14771 459 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 INPPL1O15357 1258 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NCAM2O15394 837 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NDUFS2O75306 463 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 RFPL2O75678 378 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CNPP09543 421 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SPATA31D3P0C874 917 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PCP11498 1178 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 KCNA2P16389 499 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TGM1P22735 817 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 WASP42768 502 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 STAT5BP51692 787 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CLCN4P51793 760 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 STARD6P59095 220 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GPC5P78333 572 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FAM189BP81408 668 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GHRHRQ02643 423 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 BTKQ06187 659 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TUSC3Q13454 348 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SEC23AQ15436 765 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TTC38Q5R3I4 469 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 USP45Q70EL2 814 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.05□□□□□ -1.6
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