RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411326.1

RNU6-575P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 575, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-575P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-575P-201ENST00000411326 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PEPDP12955 493 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 CPA1P15085 419 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 DUSP1P28562 367 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 RCAN1P53805 252 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 GPC5P78333 572 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 CNGA3Q16281 694 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 CEP85Q6P2H3 762 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 OR4N4Q8N0Y3 316 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ESX1Q8N693 406 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ASB12Q8WXK4 309 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 MMS19Q96T76 1030 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PRRX2Q99811 253 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 CPNE5Q9HCH3 593 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PDP2Q9P2J9 529 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 SUFUQ9UMX1 484 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 COL4A3Q01955 1670 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 M0QZQ0 153 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 CLIC1O00299 241 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 STX16O14662 325 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 FYB1O15117 783 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ANP32CO43423 234 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 TSPAN3O60637 253 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PRAMEF2O60811 474 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 RHOBTB3O94955 611 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 DRD4P21917 467 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PCSK6P29122 969 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 SLC8A1P32418 973 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 DDIT3P35638 169 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 RARRES1P49788 294 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 CFHR3Q02985 330 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 TLE2Q04725 743 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 TLE3Q04726 772 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 MAPK7Q13164 816 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 VSTM1Q6UX27 236 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 C16orf89Q6UX73 402 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 GLMPQ8WWB7 406 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 STAMQ92783 540 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 HVCN1Q96D96 273 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 MPP4Q96JB8 637 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 SNX18Q96RF0 628 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 DUSP26Q9BV47 211 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 TRIM2Q9C040 744 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 TOR3AQ9H497 397 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 RASSF1Q9NS23 344 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 PNMA2Q9UL42 364 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 GRID2IPA4D2P6 1211 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 RAMP2O60895 175 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 FZD7O75084 574 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 MT-CO3P00414 261 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 GCP02774 474 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 KRT9P35527 623 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 VPS41P49754 854 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 AGTR2P50052 363 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 TAS2R50P59544 299 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 WDR5P61964 334 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 CYP4F2P78329 520 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 KCNB1Q14721 858 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 GPR162Q16538 588 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 LRRC24Q50LG9 513 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-575P-201ENST00000411326 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.93□□□□□ -1.62
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