RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322090.7

NIPSNAP2-201, Transcript of nipsnap homolog 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP2, Length 1,999 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PBX3P40426 434 aa23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GAD2Q05329 585 aa23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MFSD5Q6N075 450 aa23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.354e-8■□□□□ 10.8
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SCD5Q86SK9 330 aa23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 VWCEQ96DN2 955 aa23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TTC25Q96NG3 672 aa23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TKTL2Q9H0I9 626 aa23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HACD1B0YJ81 288 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 E7ESA3 106 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MFSD11O43934 449 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PGFP49763 221 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 KCNJ11Q14654 390 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 DDR2Q16832 855 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RTP2Q5QGT7 225 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NUP93Q8N1F7 819 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CHADO15335 359 aa23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GCATO75600 419 aa23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ARL4CP56559 192 aa23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C4orf22Q6V702 233 aa23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SCML2Q9UQR0 700 aa23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 IRAK2O43187 625 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ITGB8P26012 769 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GPR15P49685 360 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ATP1A2P50993 1020 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GPR17Q13304 367 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 IKBKEQ14164 716 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 LONRF1Q17RB8 773 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SERPINB12Q96P63 405 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SMOC2Q9H3U7 446 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NMUR1Q9HB89 426 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RAB6BQ9NRW1 208 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 IL37Q9NZH6 218 aa23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C5orf60A6NFR6 353 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SMIM23A6NLE4 172 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 AGTP01019 485 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ERCC2P18074 760 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SLCO1A2P46721 670 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MON1AQ86VX9 555 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 A6NNZ2 444 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 EFEMP2O95967 443 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MAGEA6P43360 314 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TPI1P60174 286 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SMARCB1Q12824 385 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CBLBQ13191 982 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 STAT4Q14765 748 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MSS51Q4VC12 460 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 FAM182AQ5T1J6 154 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TTPALQ9BTX7 342 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 OR12D3Q9UGF7 316 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 A0A1W2PQH9 124 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 FAM92AA1XBS5 289 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MTMR11A4FU01 709 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 H7C4K7 107 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 KIAA0355O15063 1070 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 UPP2O95045 317 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CCDC13Q8IYE1 715 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PDIK1LQ8N165 341 aa23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms