RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 WDR27A2RRH5 827 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 SETD4Q9NVD3 440 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 CNGA2Q16280 664 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 CCNJLQ8IV13 435 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 PDP2Q9P2J9 529 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 FBXO21O94952 628 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 MAPK10P53779 464 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 VAV1P15498 845 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 CD302Q8IX05 232 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 KIFC1Q9BW19 673 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.96■□□□□ 0.95
ZBED3-201ENST00000255198 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 OR1E1P30953 314 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ARMC4Q5T2S8 1044 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 AHSPQ9NZD4 102 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 MAPK11Q15759 364 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 HS6ST1O60243 411 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 FAM228BP0C875 321 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CES3Q6UWW8 571 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM114B3SHH9 223 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 RRM1P23921 792 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 KLRK1P26718 216 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CISHQ9NSE2 258 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 LY6KQ17RY6 165 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ADAM32Q8TC27 787 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 MIEF2Q96C03 454 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CXorf56Q9H5V9 222 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 GARTP22102 1010 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 PAICSP22234 425 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 SLC22A9Q8IVM8 553 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 PTPN3P26045 913 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 SLC1A6P48664 564 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 TBX4P57082 545 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CCNIQ14094 377 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 EXO5Q9H790 373 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC154A6NI56 674 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 MARC1Q5VT66 337 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 WHRNQ9P202 907 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ADIGQ0VDE8 80 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 S100A13Q99584 98 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 TYMPP19971 482 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CCR1P32246 355 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ATP1A4Q13733 1029 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 UBASH3BQ8TF42 649 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 SNPHO15079 494 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 KRT6AP02538 564 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 KRT6BP04259 564 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 KRT6CP48668 564 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 STYK1Q6J9G0 422 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 RAD51BO15315 384 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms