RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 EXOC4Q96A65 974 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ARL8AQ96BM9 186 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 VWCEQ96DN2 955 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA17Q96L03 361 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TTPALQ9BTX7 342 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXO44Q9H4M3 255 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ABCC13Q9NSE7 274 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 VPS18Q9P253 973 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PAK5Q9P286 719 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SCML2Q9UQR0 700 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RAD54BQ9Y620 910 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 H7C0C1 242 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA0355O15063 1070 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ALOX15BO15296 676 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GCATO75600 419 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TCEA3O75764 348 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC4O95801 387 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 IFNB1P01574 187 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ABHD2P08910 425 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 OR4Q2P0C623 313 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ETS1P14921 441 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HTR7P34969 479 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP5OP48047 213 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 VPS41P49754 854 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RABGGTBP53611 331 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GDF10P55107 478 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NME3Q13232 169 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DPYSQ14117 519 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC29A2Q14542 456 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TERF2Q15554 542 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NPNTQ6UXI9 565 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RFX8Q6ZV50 586 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SCD5Q86SK9 330 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TAC4Q86UU9 113 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 UNC45BQ8IWX7 931 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NUP93Q8N1F7 819 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC25Q96NG3 672 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 OLFM3Q96PB7 478 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DDIT4Q9NX09 232 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 C5orf60A6NFR6 353 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 A6NNZ2 444 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 E7ESA3 106 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DCLK1O15075 740 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CHADO15335 359 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 IRAK2O43187 625 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TIMP1P01033 207 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TSHRP16473 764 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GOT1P17174 413 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 AMPD1P23109 780 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GBE1Q04446 702 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP2R5DQ14738 602 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF787Q6DD87 383 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms