RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 PLIN3O60664 434 aa22.83■■□□□ 1.25
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HTATSF1-201ENST00000218364 USP1O94782 785 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC4P56524 1084 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A3Q00325 362 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 BTKQ06187 659 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PKDCCQ504Y2 493 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ARIH2O95376 493 aa22.83■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 MLNP12872 115 aa22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 RGS7P49802 495 aa22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB27AP51159 221 aa22.83■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 C16orf46Q6P387 395 aa22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.83■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.83■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 IRX4P78413 519 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM187BQ17R55 369 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PMF1Q6P1K2 205 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM110Q86TL2 294 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 AZIN2Q96A70 460 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 KLRG1Q96E93 195 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SIN3BO75182 1162 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ERFP50548 548 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PACS1Q6VY07 963 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 RAPH1Q70E73 1250 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PDSS2Q86YH6 399 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 MMP19Q99542 508 aa22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.82■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.81■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZCCHC18P0CG32 403 aa22.81■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DESP17661 470 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 GRK2P25098 689 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CLCN3P51790 818 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ACAD11Q709F0 780 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 C12orf29Q8N999 325 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM4Q9C037 500 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 HESX1Q9UBX0 185 aa22.81■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR27A2RRH5 827 aa22.8■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 PRKCGP05129 697 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 POLE2P56282 527 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 AMHR2Q16671 573 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 INSCQ1MX18 579 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF111Q6ZNA4 994 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 JADE3Q92613 823 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP2A3Q93084 1043 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 SORT1Q99523 831 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.8■■□□□ 1.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.8■■□□□ 1.24
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