RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SNX16P57768 344 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 KDSRQ06136 332 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 NNTQ13423 1086 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 POPDC2Q9HBU9 364 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CFAP54Q96N23 3096 aa25.95■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 GLI1P08151 1106 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 NUGGCQ68CJ6 796 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TERB1Q8NA31 727 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 NEK11Q8NG66 645 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 ASNSD1Q9NWL6 643 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 FBXO10Q9UK96 956 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SLC8A2Q9UPR5 921 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 GFRA3O60609 400 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 IQCB1Q15051 598 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 FYB2Q5VWT5 728 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 UNC45BQ8IWX7 931 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TMEM35BQ8NCS4 154 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 P2RY11Q96G91 374 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SERPINB11Q96P15 392 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 CAPN9O14815 690 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SOX5P35711 763 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SEC13P55735 322 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 ZNF445P59923 1031 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 PTPN20Q4JDL3 420 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 C2orf27AQ580R0 203 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 EFHC1Q5JVL4 640 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SYPL2Q5VXT5 272 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 ZNF677Q86XU0 584 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 KCNV2Q8TDN2 545 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 AZIN2Q96A70 460 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TLR6Q9Y2C9 796 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TBC1D3BA6NDS4 549 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 GFRA2O00451 464 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TRIM24O15164 1050 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 LSM8O95777 96 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 LMNAP02545 664 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 CYBBP04839 570 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TBX4P57082 545 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 DMC1Q14565 340 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 ADGRF1Q5T601 910 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 OLFML1Q6UWY5 402 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 LONP2Q86WA8 852 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 BHMTQ93088 406 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SPAG5Q96R06 1193 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 PLK2Q9NYY3 685 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 MMP17Q9ULZ9 603 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 ANTXRLA6NF34 631 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 HSF2BPO75031 334 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 GFPT2O94808 682 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 ERBB2P04626 1255 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 CISD3P0C7P0 127 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 DGKGP49619 791 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 DMWDQ09019 674 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TAF3Q5VWG9 929 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SLC39A13Q96H72 371 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SLC2A13Q96QE2 648 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 EPC1Q9H2F5 836 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 STARD13Q9Y3M8 1113 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 IGLV3-25P01717 112 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 STAT1P42224 750 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 GABRB2P47870 512 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 FNTBP49356 437 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TAF5Q15542 800 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 TAC4Q86UU9 113 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 WDR5BQ86VZ2 330 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 IL17RCQ8NAC3 791 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SYNCQ9H7C4 482 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 SDK1Q7Z5N4 2213 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-220ENST00000618056 CAVIN2O95810 425 aa25.9■■□□□ 1.74
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