RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614239.1

LHX1-201, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX1, Length 3,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-201ENST00000614239 PPP2R5DQ14738 602 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 PDIK1LQ8N165 341 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 CD247P20963 164 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 XIAPP98170 497 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 ADRM1Q16186 407 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 FAM209AQ5JX71 171 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 USP37Q86T82 979 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 CYGBQ8WWM9 190 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 PGBD4Q96DM1 585 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 LAMB2P55268 1798 aa14.53□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 ACADVLP49748 655 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 DLG4P78352 724 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 GABPAQ06546 454 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 ADAM32Q8TC27 787 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 HTRA1Q92743 480 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 MARK4Q96L34 752 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 PKP2Q99959 881 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 ACSS2Q9NR19 701 aa14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
LHX1-201ENST00000614239 AQP9O43315 295 aa14.52□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 WEE2P0C1S8 567 aa14.52□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 C11orf74Q86VG3 221 aa14.52□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.52□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 BANPQ8N9N5 519 aa14.52□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 APOPT1Q96IL0 206 aa14.52□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 PARVGQ9HBI0 331 aa14.52□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 CLIC3O95833 236 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 GRK2P25098 689 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 ART3Q13508 389 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 PDPK2PQ6A1A2 396 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 RAB20Q9NX57 234 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 RAB26Q9ULW5 256 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 H6PDO95479 791 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 BCL10O95999 233 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 ZNF23P17027 643 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 KRT76Q01546 638 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 GPR162Q16538 588 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 PDXKO00764 312 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 TEX28O15482 410 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 ARPP19P56211 112 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 ZNF394Q53GI3 561 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 SP8Q8IXZ3 490 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 PARP8Q8N3A8 854 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 CITED4Q96RK1 184 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 SERPINI1Q99574 410 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 SCN7AQ01118 1682 aa14.51□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 CASZ1Q86V15 1759 aa14.5□□□□□ -0.09
LHX1-201ENST00000614239 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms