RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	GM2A	P17900	193 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	TGM2	P21980	687 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	YY1	P25490	414 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	L1CAM	P32004	1257 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	HAUS5	O94927	633 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	CCNA1	P78396	465 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	AP1B1	Q10567	949 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	NME3	Q13232	169 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	NME8	Q8N427	588 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SMTN-222	ENST00000612341	SMAP	O00193	183 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	ALAD	P13716	330 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	GMPR	P36959	345 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	ETV4	P43268	484 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	NEK3	P51956	506 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	OLIG2	Q13516	323 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	APOE	P02649	317 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	MMP3	P08254	477 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	PAX3	P23760	479 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	SNX27	Q96L92	541 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	ATP5H	O75947	161 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	EPHX2	P34913	555 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	NDUFV1	P49821	464 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	RCN2	Q14257	317 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF670	Q9BS34	389 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	CYP2C9	P11712	490 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	SULT1E1	P49888	294 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	RASSF2	P50749	326 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	BST1	Q10588	318 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	STIL	Q15468	1287 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	DGKD	Q16760	1214 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	MIPEP	Q99797	713 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	EBF2	Q9HAK2	575 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341		I3L4J1	428 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	SLC18A2	Q05940	514 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	CCL15	Q16663	113 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SMTN-222	ENST00000612341	KYAT1	Q16773	422 aa		13.32	□□□□□ -0.28

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